実験の失敗により蝿男と化した科学者セスと恋人ベロニカの子供マーチンは、人間とハエの混合遺伝子を受け継いでおり、父の発明した物質転送装置を再び作動させるため、研究所で育てられる。わずか5年で成人へと成長したマーチンは、コンピュータ・プログラマーのベスと恋に落ち、脱走を試みるが…………。