過酷な旅で一人娘を失ったゴア（クリスチャン・ベール）は自分たちが祈りをささげていた神々が、自分たちを救済する気など毛頭ないことを知り、「呪いの剣」を手にし、神を殺す。そして絶望した彼は、全宇宙の神々を抹殺することを誓う。そのころ地球に移住したアスガルドの人々が住む町に、ジェーン（ナタリー・ポートマン）がやってくるが、粉々に砕けたムジョルニアは彼女の手の中で復活する。神殺しの存在を知ったソー（クリス・ヘムズワース）はアスガルドの街に戻り、8年ぶりにジェーンと再会するが、町はゴアに急襲され、子供たちが攫われてしまう･･･。