1971年、ＮＹにすむ写真家のユージン・スミス（ジョニー・デップ）のもとを、一人の女性が訪ねた。彼女はアイリーン（美波）。彼女はユージンに「日本で公害に苦しむ人々の姿を撮影して、世界に伝えてほしい」と懇願する。初めは難色を示したが、ケンカして袂を分かっていたライフ誌の社長（ビル・ナイ）を説得して、日本の「ミナマタ」を訪れた。そこで彼を待ち構えていたのは、想像だにしていなかった、水俣の人々の苦しみだった･･･。