表向きはソフトウェア会社に勤務するプログラマー。裏の顔は「ネオ」の名で暗躍するハッカー。そのネオの前に、ハッカー界の伝説で、数年前に姿をくらました「トリニティ」が突然現れた。もう一人の伝説、ハッカーなら誰しも憧れるモーフィアスにネオを会わせてくれると言うのだ。半信半疑のネオ。だが、トリニティとの接触が「システム」に察知され、ネオ自身もシステムにつけ狙われることに。否応なくモーフィアスに会うネオ。そこで彼は衝撃の真実を告げられる。この世界の真の姿について。人類が戦う本当の敵について。モーフィアスらは、この戦いでネオが「救世主」となることを期待しているという。ネオはこの告白を受け入れられるか。そして本当に救世主になれるのか・・・？ワイヤーアクションと特殊撮影が融合した20世紀最後のSF超大作。136分。