ニューヨークを襲った大地震はマンハッタンを孤島化させた。 いまやマンハッタンは犯罪者の巣となる。 そこへ革命思想を抱く大統領の娘が国家機密装置を持ち逃亡する。 途方に暮れた大統領に希望の光を与えたのはスネーク・プリスケンの生存だった。 スネークは大統領に機密装置の奪還を依頼されるが拒否する。 しかし、大統領はスネークの体に１０時間後に発動する獰猛な神経破壊ウィルスを植え込み、 任務を成功させたら解毒剤を打つ。という強制的な手段にでた。 スネークは依頼を決行せざるを得なくなりマンハッタン島へと向かう・・・。