架空の昭和３０年代の日本。そこでは、政府の政策に反発を抱く、武装した反政府ゲリラによるテロが多発していた。政府は首都圏のテロを武力で制圧するために、首都圏治安警察機構を組織。その中核をなすのは、強化服と重火器で武装した＜ケルベロス＞と呼ばれる特機隊だった。ある日、＜赤ずきん＞とよばれるゲリラの武器を運ぶ未成年の少女を、地下水道で追いつめた特機隊の伏一貴。その時、この二人の間に起きた事件をきっかけに、治安の安定と共に必要性の薄れた首都圏治安警察機構と公安との生き残りを賭けた争いが始る。