普段はさえないバツイチ男だが、特殊スーツを身に纏うことで、身長1.5ｃｍのヒーロー「アントマン」になれるスコット（ポール・ラッド）。あの事件（※）のせいでFBIの監視下に置かれ、一人娘にもなかなか会えない。ホープ（エヴァンジェリン・リリー）とも絶縁状態。ところがホープの父・ピム博士（マイケル・ダグラス）から、博士の研究の秘密が詰まった研究所を狙うものが現れたという。そんな折、彼らは物をすり抜ける能力を持つ「ゴースト」の襲撃を受ける･･･。