関ヶ原の戦いが終わり、天下は徳川家康のもとに統一されつつあった。 家康の後ろ盾である僧正「南光坊天海」佐藤慶は戦乱の素となる危険因子の排除（枝打ち）を実行する暗殺部隊の育成を腹心の部下「小幡月斎」原田芳雄に指示する。 「小幡月斎」は幼い戦災孤児１０名を集め、山奥で年月と全力を傾注して恐るべき「暗殺集団」を作り上げた。その中で「あずみ」上戸彩は唯一の女性であり、最も優れた技を身に付けた戦士へと成長する。 訓練の仕上げには、暗殺者としての資質を問われる過酷な試練が待ち受けていた。